Mokykla vykdo pradinio ugdymo ir pagrindinio ugdymo programos pirmosios dalies programas, formalųjį švietimą papildančio pradinio ugdymo Dailės skyriaus programa
Kėlimas į aukštesnę klasę vykdomas pagal NUOSEKLIOJO MOKYMOSI PAGAL BENDROJO LAVINIMO PROGRAMAS TVARKOS APRAŠĄ, patvirtintą Lietuvos Respublikos Švietimo ir mokslo ministro 2012 m. gegužės 8 d. įsakymo Nr. V-766 redakcija.
Šiaulių Gegužių progimnazijos 2021_2022 m.m. ugdymo planas
Ugdymo plano 2021-10-26 keitimo įsakymas Nr. V-87. NEGALIOJA
Ugdymo plano 2022-04-28 keitimo isakymas_Nr. VŠ-13.
Vykdomos (integruojamos) programos 2022 m.
Progimnazijoje teikiama išskirtinė galimybė mokiniams – sužinoti, išmokti, susipažinti – lankyti dalykų modulius. Moduliai 2021-2022.